植物染色体荧光原位杂交

  1. 首页
  2. 指标测定方法
  3. 植物染色体荧光原位杂交

原理

    首先,染色体中的目的基因与带有地高辛或生物素标记的互补序列DNA或RNA探针杂交形成较稳定的杂交复合物。接着探针上的地高辛再与连接荧光素的抗地高辛抗体,或生物素再与连接荧光素的抗生物素抗体进行抗原-抗体反应结合。由于标记的荧光素在荧光显微镜下经过不同波长的激发光激发,可发射出不同颜色的荧光,因此,通过荧光素发射出的荧光可检测出目的基因在染色体中的分布位置。图1为地高辛-抗地高辛系统检测原位杂交示意图。

植物染色体荧光原位杂交测定

仪器设备

1.温箱。 2.高压灭菌锅。
3. 微量加样器。 4.荧光显微镜。
5.显微镜。 6.恒温水浴锅。
7.载玻片,盖玻片。 8.酒精灯。
9.湿盒(取-一个大的培养皿,垫几层滤纸,用2X SsC溶液浸湿)。

 

试剂

     1.3 X PBS(磷酸缓冲液):390mmol•L-1NaCl、30 mmol•L-1 Na2HPO4和390 mmol•L-1NaCl、30 mmol•L-1 Na2HPO4,按1 :1混合得到3X PBS,pH7.0,用蒸馏水稀释成1X PBS。

     2.20 X SSC( standard saline citrate) : NaCl 175g,柠檬酸三钠88g,用双蒸水溶解,1 mol•L-1 HCI调节pH为7.0,双蒸水定容至1000mL。其他各级SSC可由贮存液加双蒸水稀释获得。

     3.卡诺固定液:95%乙醇:冰醋酸=3: 1。4.各级乙醇,45%乙酸,1%醋酸洋红。

     4.各级乙醇，45%乙酸，1%醋酸洋红。

     5. 70%甲酰胺/2XSSC:35mL甲酰胺,5mL 20 X SSC,10mL水。

     6. 50%硫酸葡聚糖(DS):65℃水浴中融化,4℃或一20℃保存。

     7.杂交液:100%甲酰胺20μL,50%DS8μL,20 X SSC 4 μL,探针4 μL(加前100℃加热标记的探针2 min,立即放在冰上冷却,使探针变性),封阻DNA50倍于探针DNA,10% SDS 2 μL,去离子水定容至40 μL。

     8. PI( propidium iodide)/ antifade溶液

     PI原液:先以双蒸水配置溶液,浓度为100μg•mL-1,取出1mL,加39mL双蒸水,使终浓度为2.5 μg•mL-1。

     antifade原液:以PBS缓冲液配制该溶液,使其浓度为10mg•mL-1 ,用0.5 mmol•mL-1的NaHCO3调pH为8.0。取上述溶液1mL,加9mL甘油,混匀。

     PI/antifade溶液:PI与antifade原液按体积比1 :9比例充分混匀,一20℃保存备用。

     9.生物素或地高辛荧光检测试剂盒。

     10. TE(Tris/EDTA) 液:10 mmol•L-1 Tris- HC1,1 mmol•L-1 EDTA,pH8.0。

材料

    洋葱、蚕豆、大麦、小麦、大豆根尖。

方法步骤

1.中期染色体压片的制备

     (1)取样:用刀片切下根尖，置于冰水共存的冰瓶中0~3℃处理24h。目的是获得较多中期分裂相的细胞。

     (2)固定:经预处理的材料冲洗干净后,用卡诺氏固定液20℃固定20h,如果材料不立即进行压片,可置于70%乙醇溶液中待用。

     (3)染色:将固定后的材料放人盛有1%醋酸洋红染色液中染色2~4h。

     (4)分散与压片:将染色后的根尖放在干净的载玻片上,去掉根冠和伸长区部分,只留2~3mm长的分生区部分。加1滴45%乙酸,用镊子将根尖充分压碎,加盖盖玻片。在酒精灯，上微加热,稍冷却后,左手食指压紧盖片一个角,右手持解剖针,以针尖轻轻敲击盖片, 使细胞均匀分散。然后,再换用解剖针的木柄端敲击盖片,使细胞压平。最后,在该片上垫一滤纸片,用拇指紧压使其更平。

    (5)干燥压片:记下分散良好的中期细胞的坐标,并在盖玻片上标记位置后,将载玻片浸人液氮中速冻,再用解剖刀迅速掀掉盖玻片立即浸人95%乙醇中至少5s,空气中干燥。

2.探针的制备:按缺口平移DNA标记(Bio-11-dUTP或Dig-11-dUTP)试剂盒操作。

    (1)取10μL模板DNA加入一新的离心管中,100℃加热2min,立即转移到冰浴内冷却，12000g离心15 min。

    (2)倒掉上清液放在冰上,加入下列试剂:

     10 μL Bio-11-dUTP或Dig-11-dUTP标记的混合dNTP;

     5μLDNA聚合酶I;

     5μL新稀释的DNaseI(取2μLDNaseI加988μL重蒸水);

    双蒸水加至50μL,短暂离心收集反应液在离心管的底部。

    (3)置15。C水浴中2h。

    (4)加5μLTE终止反应。

3.原位杂交

     (1)染色体压片的变性:将染色体压片在60℃烘箱干燥1h后,用RNase A 37摄氏度处理1 h,

     2 X SSC漂洗5min,70%去离子甲酰胺70℃变性2~3 min,再分别在-20℃预冷的70%、80%、90%、100%乙醇中各脱水5min,空气干燥。

     (2)杂交:变性处理后的每张压片加40mL杂交液,覆盖盖玻片后置湿盒中,60℃温浴10min,37℃杂交过夜。

     (3)漂洗:2XSSC室温10min,30%去离子甲酰胺37℃ 10 min,2 X SSC室温10 min,1 X SSC室温10 min，PBS冲洗平衡。

     (4)加稀释的兔抗生物素或地高辛抗体40μL,置湿盒中37℃浮育1h。

     (5)PBS漂洗4次,每次10 min。

     (6)加荧光素(FITC)标记的羊抗兔免疫球蛋白溶液,置湿盒中37℃浮育1 h。

     (7) PBS漂洗4次,每次10 min。

     (8)用PI/antifade溶液染色2 min。

     (9)蒸馏水漂洗4次，每次10 min。

     (10)加盖盖玻片,用无荧光封片剂封片,荧光显微镜下观察。

注意事项

    1. DNaseI的作用是在DNA双链上作用产生缺口,它的浓度和反应的时间长短与标记的探针的长度密切相关,通常以DNA片段长约300~500 bp为宜。如片段较大,会使探针的渗透性降低,降低杂交率。这时应加适量DNaseI继续酶切,直至DNA片段长度合适后，加5μLTE终止反应;如果DNaseI的浓度太大或酶切时间过长会使合成的探针太短,容易产生非特异结合,造成本底增加。因此，最好用8.0g•L-1琼脂糖/TBE缓冲液凝胶电泳检测标记探针的大小。

    2.探针与目的DNA的特异性一定要强。

    3.在制备中期染色体压片时，载玻片一定要清洗干净，否则染色体容易掉。

 

相关阅读：
《植物组织中糖、淀粉和纤维素含量的测定》

检测服务