紫外吸收光谱法
原理
DNA在260nm处有一个明显的吸收峰。若吸收峰出现偏差，则说明样品有RNA或其他非核酸类杂志。对于较纯的样品，还可以通过260nm处的吸光度估测样品的浓度。
仪器设备
紫外分光光度计，配石英比色杯，光程1cm。
试剂
TE缓冲液。
材料
从植物组织中提取的DNA样品。
方法步骤
1.取溶于TE缓冲液的DNA样品分别于260nm和280nm比色，测定吸光度，分别以A260和A280表示。正常值应为A260/A280=1.8+0.1。若存在偏差，则说明样品中有RNA或其他杂志。
2.与200-300nm范围内扫描样品的紫外吸收光谱。DNA应在260nm处有明显的吸收峰。
3.在1cm光程下，较纯的DNA可根据A260的估值来估测浓度：
DNA样品的琼脂凝胶电泳快速测定
原理
琼脂凝胶可以构成一个直径从50-200nm的三维筛孔通道，可分离1-25kb范围内的DNA片段。在水平电场中，低电压时，DNA片段的迁移率与所用的电压成正比。DNA样品可通过溴化乙锭（EB）染色，在紫外灯下直接观察到荧光。
仪器设备
1.电泳设备一套：包括电源、水平电泳槽和梳子。
2.胶带。
3.恒温水浴或微波炉。
4.20μL加样枪或毛细滴管。
5.三角瓶。
试剂
1.电泳缓冲液：常用1xTAE或0.5xTBE。配方检附表1-1。一般配制5x或10x储存液，实验时稀释。
2.溴化乙锭（EB）贮存液：10mg•mL-1，温室避光保存。
3.琼脂糖溶胶：根据附表1-2确定琼脂糖溶胶的浓度。琼脂糖溶液的体积以倒入水平电泳槽3-5mm厚为宜。确定胶浓度和体积后，称取足量琼脂糖干粉，加到盛有定好量的电泳缓冲液的三角瓶中，加盖（不要盖紧），置沸水浴中加热到琼脂糖融化，转移至55℃水浴。待温度平衡后，加入EB，使后者终浓度为0.5μg•mL-1。轻轻旋转混匀溶胶，置55℃水浴保温备用。
4.样品缓冲液：见附表1-3。使用何种样品缓冲液依个人习惯。
5.DNA标准样品（用于测定DNA相对分子质量）：根据所分离DNA分子的大小，可选购高分子质量标准（1-20kb）或低分子质量标准（100-1000bp）。按说明书用样品缓冲液稀释后使用。
材料
从植物组织中提取的DNA样品。
方法步骤
1.清洗电泳槽，用胶带将电泳槽模具开放的两边封起。
2.将55℃的琼脂糖溶液倒入电泳槽，至胶厚度为3-5mm,插上梳子。注意胶内及梳齿间不能出现气泡。
3.待胶凝固后，加少量电泳缓冲液于凝胶顶部，小心拔出梳子，倒出电泳缓冲液，撕去封边胶带，将凝胶安放到电泳槽内。
4.向电泳槽内加人电泳缓冲液，淹没凝胶约1mm。
5.混合DNA样品和0.2x体积样品缓冲液。
6.点样。分子质量标准样应在样品孔的左右两侧各点一个。
7.盖上电泳槽盖，施加1-5μ/cm电压进行电泳（其中距离以阳极至阴极之间的测量为准）。电泳至溴酚蓝迁移到适当距离即可用紫外灯进行检测。
注意事项
1.EB是较强的诱变剂，在配制、使用过程中不要接触皮肤。含EB的胶、缓冲液等用后应单独贮存，不可随意倾倒、丢弃。
2.点样量：应根据DNA样品浓度和样品孔的容积确定。一般宽度为5mm的DNA条带用EB染色后的最小检出量为2ng。如单孔DNA上样量超过500ng则会出现过载现象，造成条带拖尾、模糊不清。上样体积也不宜过大，应避免从加样孔溢出污染邻孔样品。
3.电泳时间：电泳过程中可以随时关闭电源用紫外灯检测DNA条带是否分开。达到实验要求后即可停止电泳，不必等待指示剂迁移至凝胶边缘。快速检测时，可将电压适当提高，将电泳时间控制在30min以内。但高压电对大片段DNA的分离效果不好。
附表
| 表1-1 几种常用的电泳缓冲液 | ||
| 缓冲液 | 工作液 | 储存液/L |
| TAE | 1X | 50X |
| 242g Tris | ||
| 40mmol•L-1 Tris-乙酸盐 | 57.1mL 冰乙酸 | |
| 1mmol•L-1 EDTA | 100mL0.5mol•L-1 EDTA(pH8.0) | |
| TPE | 1X | 10X |
| 108g Tris | ||
| 90mmol•L-1 Tris-磷酸盐 | 15.5mL磷酸(85%,1.679g•mL-1) | |
| 2mmol•L-1 EDTA | 40mL0.5mol•L-1 EDTA(pH8.0) | |
| TBE | 0.5X | 5X |
| 54g Tris | ||
| 45mmol•L-1 Tris-硼酸盐 | 27.5g硼酸 | |
| 1mmol•L-1 EDTA | 20mL 0.5mol•L-1 EDTA(pH8.0) | |
| 表1-2 琼脂糖浓度与所分离DNA片段大小的关系 | |
| 琼脂糖浓度/% | DNA大小 |
| 0.5 | 700bp-25kb |
| 0.8 | 500bp-15kb |
| 1.0 | 250bp-12kb |
| 1.2 | 150bp-6kb |
| 1.5 | 80bp-4kb |
| 表1-3 常用样品缓冲液配方(6X) | ||
| 缓冲液类型 | 6X缓冲液(质量浓度) | 储存温度 |
| I | 0.25%溴酚蓝 | 4℃ |
| 0.25%二甲苯氰FF | ||
| 40%蔗糖水溶液 | ||
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