1945 年发现,突变体苞片细长扭曲、不能包裹花蕾,利于农药附着、减轻虫害、降低机采棉杂质。遗传分析表明该性状由**单隐性核基因控制**,前期研究将 fg 位点初步定位在 A03 染色体,但调控该性状的致因基因尚未被克隆。CNL 类基因大多参与植物免疫,部分功能获得型点突变会造成基因自激活,引发免疫反应,改变植物形态;但 CNL 如何调控植物器官形态建成的分子机制尚不清晰。本研究旨在克隆 fg 基因,解析棉花苞片形态发育调控机制,并将该性状应用于海岛棉育种。
| 文献标题 | A CC‑NB‑ARC‑LRR Gene Regulates Bract Morphology in Cotton |
| 文献译名 | CC-NB-ARC-LRR基因调控棉花分枝形态 |
| 期刊名称 | Advanced Science |
| 影响因子 | 14.1 |
| 发表时间 | 2024年10月04日 |
| 第一作者 | 严孙艺 |
| 通讯作者 | 胡艳 |
| 单位 | 浙江大学 |
| DOI | https://doi.org/10.1002/advs.202406111 |
| 检测支持 | 南京卡文思检测协助完成了植物激素相关 的工作,为该项目提供了充分的理论依据和理论支持。 |
1945 年发现,突变体苞片细长扭曲、不能包裹花蕾,利于农药附着、减轻虫害、降低机采棉杂质。遗传分析表明该性状由**单隐性核基因控制**,前期研究将 fg 位点初步定位在 A03 染色体,但调控该性状的致因基因尚未被克隆。CNL 类基因大多参与植物免疫,部分功能获得型点突变会造成基因自激活,引发免疫反应,改变植物形态;但 CNL 如何调控植物器官形态建成的分子机制尚不清晰。本研究旨在克隆 fg 基因,解析棉花苞片形态发育调控机制,并将该性状应用于海岛棉育种。
与正常苞片材料 TM‑1 相比,fg 突变体 T582 苞片狭长卷曲,无法包裹花蕾,苞片面积仅为 TM‑1 的 1/4;二者杂交得到的 F₁苞片呈现中间表型。形态上,TM‑1 苞片锯齿均匀、叶脉呈放射状分布;T582 苞片锯齿仅集中在苞片上端,叶脉平行排布。细胞学观察表明,突变体苞片表皮细胞纵向显著伸长、排列松散,而两类材料的叶肉细胞均未分化出典型栅栏与海绵组织,证明苞片属于变态叶,细胞纵向过度伸长、横向扩展受抑是该突变表型的细胞学基础。
F₂、BC₁分离群体表型统计和卡方检验证实,frego 苞片性状由**单隐性核基因**控制。先利用 BSA‑seq 将 fg 初定位至 A03 染色体,再开发 SNP、InDel 标记开展精细定位,最终锁定 1 Mb 候选区间。结合重测序与转录组数据比对,发现区间内*GH_A03G0230*在外显子区域存在错义突变,其余变异多位于非编码区;KASP 分型结果显示该基因位点与 frego 苞片性状共分离,确定其为关键候选基因。
在 T582 与 MD51ne 两份 fg 突变材料中对候选基因进行 VIGS 沉默,qPCR 检测确认基因表达显著下调后,突变苞片形态向正常苞片恢复,苞片整体长宽比与表皮细胞长宽比明显降低,叶脉恢复放射状排列,由此确认 GH_A03G0230 即为 fg 致因基因,命名为 Ghfg。序列比对发现 T582 的 Ghfg 共有 7 处序列变异;烟草瞬时表达试验进一步证实,突变型 Ghfg 可诱导叶片细胞坏死,该蛋白发生自激活。
设置两组转基因验证:在突变材料 MD51ne 背景下利用 CRISPR/Cas9 敲除 Ghfg,获得多个敲除株系,苞片形态恢复正常,直接证明 Ghfg 突变是 frego 苞片性状的成因;将突变型 Ghfg 由 35S 启动子驱动在正常材料 TM‑1 中过表达,却未观察到典型突变苞片表型,推测稳定转基因植株中目的基因表达水平不足,不足以激活下游通路。
对 TM‑1 和 T582 的幼嫩苞片原生质体开展单细胞转录组测序,聚类得到 12 个细胞簇,归为 7 大类细胞类型,并通过标记基因与原位杂交完成细胞身份注释。组学对比显示,正常苞片增殖细胞富集生长素信号、细胞壁重塑通路,而突变苞片增殖细胞显著富集氧化应激、防御相关通路;VIGS 沉默材料转录组结果也与之一致,说明增殖细胞是表型差异的核心细胞群,苞片形态建成受生长素稳态和 ROS 平衡共同调控。
对不同材料苞片进行生理指标测定,结果显示 fg 突变苞片的 CAT、SOD、POD 抗氧化酶活性以及 MDA 含量均显著高于正常苞片;NBT 组织染色直观证明突变苞片内 ROS 大量累积。说明自激活的 Ghfg 能够持续触发苞片内部氧化应激,诱导抗氧化系统响应。
分发育阶段、分区段取样,借助 LC‑MS/MS 测定苞片内源激素。正常 TM‑1 苞片内生长素 IAA 沿基部到顶端均匀分布;而 fg 突变苞片的生长素大量富集在苞片远端顶端,形成极强的基‑顶浓度梯度。细胞分裂素在不同材料间无稳定差异,赤霉素的差异在苞片发育后期消失。顶端富集的生长素驱动细胞优先纵向伸长,最终形成狭长卷曲的苞片。
海岛棉纤维品质优良,但原有苞片偏大,机采加工时苞片残屑会造成纤维杂质偏高。研究以海岛棉品种新海 41 作为轮回亲本,与 fg 突变材料 MD51ne 杂交,连续多代回交并结合 KASP 分子标记辅助筛选,在 BC₄世代自交后获得稳定纯合、携带 frego 苞片的海岛棉新材料 Gb.CB,为培育低杂质、适合机采的海岛棉品种提供优质种质资源。